一项随机对照试验显示，RFA的2年复发率显着低于经皮乙醇注射（PEI）。与手术切除相比，RFA术后复发率更高，复发时间更短。与开腹或腹腔镜RFA相比，经皮入路更常见复发。病变大于3 cm时复发率也较高。

在Toshimori等人的一项研究中，经皮RFA治疗后HCC的局部复发率在1年时为2。2％，3年时为7.4％，5年时为9.5％。易发生局部复发的因素包括大肿瘤大小（> 2 cm），邻近主要门静脉分支或肝静脉的肿瘤位置，以及小（<3 mm）消融边缘。

Shady等人评估了影响经皮RFA治疗的结直肠癌肝转移患者预后的因素。在多变量分析中，预测局部肿瘤无进展生存期较短的因素是肿瘤大小超过3 cm，边缘大小为5 mm或更小; 预测较短总生存率的因素是肿瘤大小超过3厘米，并且存在多于一个的肝外疾病部位。

Yamao等人将RFA（n = 33）和肝切除术（n = 71）的生存影响作为日本肝癌研究小组定义的104例肝损伤B患者的HCC初始治疗进行了比较。尽管RFA组的总体生存率（OS）趋于更好，但无组织生存期（DFS）在各组之间没有显着差异。亚组分析发现，天冬氨酸氨基转移酶高于35 IU / L，血清白蛋白低于3.5 g / dL，99mTc-半乳糖基人血清白蛋白低于0.85的患者，RFA的OS明显更好。