Barrett食管的管理随着新的内窥镜技术的出现而不断发展。传统上，患有高度不典型增生或癌症的患者被转诊进行食管切除术。然而，随着Barrett食管内镜消融治疗的出现，治疗范式发生了变化。患有高度不典型增生和粘膜内癌的患者越来越多地提供食道配对疗法。内窥镜消融治疗可以分为组织获取和非组织获取模式。发育异常的可见病变应采用组织获取方式进行治疗，以适当分期和切除病灶。可以使用一种或多种方式完全根除受影响食道的整个区域。完全根除治疗所有高危上皮细胞，因此，治疗任何异时或同步病变。治疗成功可通过完全缓解癌症，发育不良或Barrett食管来衡量。除了与手术相关的并发症外，残留Barrett食管或次级Barrett食管的风险仍有待解决。消融后目前仍需要内镜监测和酸抑制。

Barrett食管发生在食管的正常鳞状内膜转变为特殊的肠道柱状上皮时。非发育不良Barrett食管患者的食管腺癌发病率约为每年0.5％。目前被广泛接受作为进展为癌症风险的临床标志物的唯一特征是在食管活检标本的组织学检查中存在高度不典型增生。高度异型增生和Barrett食管患者发展为腺癌的风险约为每100患者年6.6例。

Barrett食管患者的传统管理涉及无发育不良或低度不典型增生的患者的监测方案。患有高度异型增生或可切除的癌症的患者接受了食管切除术。在过去几年中，由于内镜消融疗法的出现，这种管理Barrett食管的方法已经改变。患有Barrett食管和高度不典型增生或粘膜内癌的患者现在可在这些先进的内镜治疗中心提供食道保留治疗。