Ib，III和IV级证据表明，单纯膀胱尿道镜检查前的抗生素预防应仅在存在UTI危险因素的情况下进行，如高龄，泌尿道解剖异常，营养不良，吸烟，长使用皮质类固醇，免疫缺陷，固定导管，共存感染和长期住院治疗。

对于那些有任何这些危险因素的人，建议的抗生素预防包括单剂量的氟喹诺酮或甲氧苄氨嘧啶 - 磺胺甲恶唑。或者，可给予氨基糖苷（含或不含氨苄青霉素），第一代或第二代头孢菌素或阿莫西林 - 克拉维酸盐。尿培养阴性的患者和没有任何这些危险因素的患者在膀胱尿道镜检查前不需要抗生素预防。

上述建议适用于简单的膀胱尿道镜检查; 然而，所有计划接受膀胱尿道镜手术的患者都应接受抗生素预防。根据美国心脏协会（AHA），不再推荐抗生素仅用于预防与泌尿生殖器手术相关的感染性心内膜炎。