不同的皮肤镜检查分类有其自身有价值的内在连贯性; 然而，当仅使用单一指南进行评估时（即有限的定性和定量协议），观察者间和观察者间的变异性可能会影响不同诊断评分的使用。此外，所有这些分类都可以证明是非常敏感的，但不是非常具体; 因此，它们不允许100％的准确性。

尽管对于检测表皮内病变非常有用，皮肤镜检查在结节性病变或明显皮肤病变，无色素沉着病变，非常暗的病变，其中色素量不允许观察ELM体征，以及微弱色素性脂溢性疣方面受到限制。

皮肤镜检查的效率与受过训练的临床医生的综合诊断概要密切相关。在考虑皮肤镜检查结果的准确性时，用户必须考虑全球诊断术语，而不考虑所使用的方法; 更广泛的目标是包括案例历史和临床评估。

事实上，通过皮肤镜评估整合的第一步如下：

回忆（个人和家庭背景）

照片型

以前的晒伤史

完整分析整个皮肤表面（旨在找到所谓的“丑小鸭标志”）

仔细评估所检查病变的首次出现（和最终扩大）的时间和/或先前存在的病变的修改：使用放大镜仔细观察和评估病变的形状，颜色和尺寸。

传统临床诊断程序和皮肤镜检查的这种组合允许更好地分类暗示性黑素细胞病变并且显着降低不需要的活组织检查的百分比，但仅在色素沉着的皮肤病变中心中。