任何胆囊切除术，无论采用何种技术（开放式，腹腔镜或自然腔内腔内窥镜手术[NOTES]），均可引起以下并发症：

出血 - 潜在的出血来源包括肝床，肝动脉及其分支和肝门

胆管损伤 - 这些可能导致胆漏，胆管狭窄和胆管炎; 夹子从胆囊管滑落也可能导致胆漏; 然而，胆囊切除术后胆漏的最常见原因是横切Luschka的导管

NOTES手术特有的潜在并发症可以从妇科文献中描述的穹窿镜检查（通过后穹窿进入腹腔）的并发症中推断出来。在穹窿镜检查文献中描述的一种潜在并发症是肠或直肠损伤，其发生在约0.25％的病例中。 

从妇科学的角度来看，其他潜在的不良反应包括粘连的形成和先前存在的子宫内膜异位症的扩散。

尽管不孕症或性交困难的可能性曾经是一个问题，但子宫仅在通往后穹窿的途中通过并且未受伤，因此对潜在生育的任何影响都不太可能。

从关于子宫切除术的阴道通路的妇科文献中推断，性功能的保存与经腹通路的相似。然而，病人被推荐从性交不要为为期2周的。