许多研究证实，RFA是一种风险相对较低的手术，发病率和死亡率较低。很少有并发症与RFA有关。

许多因素被认为与引起严重并发症有关; 这些因素包括肿瘤大小，消融时间，电极类型（单个或簇）和操作员经验。来自意大利的一项包括41个中心的大型研究显示，RF会话数量的增加与较高的主要并发症发生率有关，与肿瘤大小或电极类型无显着相关性。

患者在手术后可立即感到不适; 这通常可以通过简单的镇痛来解决。作为后发综合征的一部分，患者也可能经历延迟疼痛。

Postablation综合征是实体腹部肿瘤RFA后的常见现象，约占三分之一的患者。后发综合症的症状是流感，包括低烧，延迟疼痛，不适，肌痛，恶心和呕吐。在手术前应告知患者后坐位综合征及其自限性。大多数患者应该能够在7-10天内恢复正常活动。

其他并发症的发生率低于5％。可能的并发症包括：

肩部疼痛

胆囊炎（几周后通常会消退）

胆管损伤，导致胆道梗阻

肠道受损

流血的

囊肿血肿

腹腔积血

气胸

血胸/胸水

胸腔积液

腹腔内出血或 腹水

胆道出血

感染和 门静脉血栓形成

肝脓肿

针道播种 - 这被认为是RFA的长期并发症; 它主要发生在靠近肝脏表面或囊的病变中

近端重要器官的附带损害 - RFA的可预测性质通常可预防这种并发症

自限性皮下蜂窝织炎

Livraghi等发现3554例治疗病灶中主要并发症（如腹膜出血，肿瘤性接种，肝内脓肿和肠穿孔）的发生率为2.2％。轻微并发症的发生率为5％，死亡率为0.3％。 Giorgio等报道了375例消融疗程的研究; 0.9％的患者出现严重并发症。在这项研究中，死亡率也报告为0.3％。 

研究表明，危及生命的急性肝功能衰竭可被认为是RFA罕见的可能并发症。Postablation存活率取决于儿童分类，肿瘤多样性和HCC的病因。研究表明，病毒性肝硬化后发生的HCC患者的预后比酒精性肝硬化后发生的HCC患者预后更差。