针头部和颈部肿块的细针穿刺（FNA）有一些局限性。未能建立准确的诊断可能是因为抽样误差。在这些情况下，建议重复抽吸，并且可以考虑切除活组织检查。负责处理，处理（经验丰富的细胞学技师）和阅读（细胞病理学家）FNA样本的人员必须接受过良好的培训。必须最小化观察者间的可变性。FNA的准确性随报告和取样的组织而变化（参见下面的具体实例）。

由于可能吸入无细胞物质，因此囊性肿块吸入后的诊断准确性可能尤其可疑。事实上，与实性颈部肿块相比，囊性颈部肿块的FNA敏感性较低（分别为73％和90％）。良好证据目前表明，当FNA使用超声或CT引导，以提高采样精度实现了最好的结果得以实现。这两种方式都允许更精确的病变定位，并且可以促进针的更准确定位以在具有中心坏死的病变中吸出囊。通过在椅旁包括细胞学家来染色并在手术终止前预览载玻片，可以进一步提高准确性。当怀疑淋巴瘤时，这也提供了获得流式细胞术的额外材料的潜力。

如果对抽吸物的解释存在任何问题，应推迟进一步治疗（例如手术，放疗，化疗）的决定，直到准确诊断肿块为止。最后，在适当的条件下使用FNA很重要。FNA补充了临床诊断，不应被视为彻底的病史和体格检查的替代品。