插入膈肌起搏器的外科手术并不复杂。为了刺激膈神经，可以将电极放在颈部或胸部。采用颈部方法，在锁骨上方制作小锁骨上切口。胸锁乳突肌收缩，膈神经在中斜角肌和前斜角肌之间行走。神经的鉴定可以通过神经模拟器和术中透视检查确认。通过胸腔镜方法刺激胸部的膈神经。在右胸腔中，可以发现膈神经在食道后面行进; 在左胸部，它位于心包的侧面。纵隔胸膜平行于膈神经切开，但是神经两侧留下几毫米的组织。该切口位于神经的前部和后部。

如果需要，也可以用电极直接刺激隔膜。在膜片中植入电极之前，完成电机映射并创建网格图算法。一旦识别出最大收缩点，就将电极植入这些部位并再次连接到外部刺激器上。腹腔镜检查通常用于在膈肌上双向植入电极。

应通过成像确认隔膜与起搏的良好收缩，阈值应在1-2 mA范围内。未能起搏或存在高阈值应导致重新评估以检测缺乏最佳功能的原因，例如不正确的连接，导线损伤，导线脱落或电极与神经之间的过量组织的插入。

电流是在荧光检查的基础上设定的。在大多数情况下，开发了一种标准化方法来评估最佳的横向偏移，并且每次都遵循该系统。在每个患者确定吸气期间隔膜的最大自愿下降。评估产生该下降所需的电流量，并将电流保持在产生所需结果的最小设定值。

术前应给予预防性抗生素以预防感染。