虚拟结肠镜检查的优点，对于某些人来说VC比传统的结肠镜检查更舒适，因为它不使用结肠镜。结果，不需要镇静，患者可以在没有其他人帮助的情况下返回他/她的日常活动或回家。由于某些人可能对常规结肠镜检查中使用的镇静药物产生不良反应，因此缺乏镇静作用也会降低手术风险。与使用钡灌肠的常规X射线相比，VC提供更清晰，更详细的图像，有时称为下胃肠（GI）系列。此外，大约十分之一的患者将不能用常规结肠镜检查完成完整的右结肠（盲肠）评估。它比传统的结肠镜检查或较低的GI系列花费的时间更短。VC提供了揭示结肠外疾病或异常的第二个好处。