随着消融方式的增加，安全有效地根除整个Barrett食管上皮已成为可能。完全根除Barrett食管是有利的，因为治疗了整个有风险的上皮细胞。由此可以有效地管理随后可能随时间发展的隐匿性，同步性病变和异时性病变。因此，使用技术或模式的组合来实现Barrett食管上皮的完全根除比局部治疗更可能维持缓解。

通过在根除Barrett食管的整个位置进行活检取样的终身监测需要监测这种病症的复发，埋藏的腺体的存在和瘤形成的发展。所有消融治疗也需要伴随酸抑制疗法，这可以防止食管远端损伤，避免Barrett食管复发，从而进展为发育异常。因此，所有接受过消融治疗的患者也应接受终生的高剂量PPI以控制反流症状。酸抑制也可降低Barrett食管患者发展为异常增生的风险。更好地了解其他因素，如遗传和分子异常，如何影响巴雷特食管和瘤形成的发展也是必要的。增加对潜在致病因素的了解可能会影响未来患者的风险分层和管理。