恶性肿瘤或粪便或血液中的恶性肿瘤的生物标志物是检测结肠直肠发育不良和瘤形成的潜在有吸引力的手段，特别是对于高危人群。不幸的是，许多常规肿瘤标志物如CEA，CA19-9和EpCAM反映炎症，而不是恶变前的变化; 因此，在癌症或癌前检测中没有确定的位置。然而，特异性分子改变（p53突变，DNA非整倍性，染色体不稳定性，K-ras突变，p14和p16高甲基化，微卫星不稳定性，年龄相关甲基化，端粒长度缩短）已经在非肿瘤上皮中以更高的频率被鉴定出来。与没有瘤形成的UC患者的非肿瘤上皮相比，UC患者的肿瘤形成。这些新兴工具可能有助于对未来内镜监测策略进行风险分层，并对患癌症风险最高的患者进行治疗干预。尽管这些新型生物标记物在内窥镜检查期间不能提高绝对病变检出率，但新兴的分子成像方法可以通过提供广泛的视野同时突出“实时”分子异常来彻底改变发育不良的检测并结合染色体内窥镜检查。一个这样的例子是使用特异性凝集素探针，其识别伴随从BO到发育异常到腺癌的转变的聚糖表达的协调变化。这些进步不仅可以帮助描绘疾病参与的程度，而且如果它们可以被验证为体内内窥镜工具，也可以为将来的治疗选择提供信息。