VCE是一种很好的替代方案或初步程序，可用作诊断工具，主要用于治疗GI中期出血。然而，无法干预是VCE的主要缺点。在DBE的文献三个荟萃分析VS VCE表明患者GI隐晦出血[相似诊断率]。一项对162名患者进行的回顾性研究证明了VCE的优势，即在Roux-en-Y环解剖和憩室患者中，DBE难以达到DBE和DBE的优势。总体而言，DBE的诊断率与VCE看起来很相似。VCE具有无创性的优点，更有可能实现完整的小肠镜检查。由于VCE可以在没有镇静的门诊环境中进行，因此不会带来麻醉的额外风险。

在大多数临床情况下，最初的方法是VCE，在解决病理部位后，DBE用于取样或治疗干预。这种顺序方法减少了手术持续时间并增强了介入成功。

单气囊小肠镜检查（SBE）是具有类似功能的类似适应症的另一种替代手术。比较SBE和DBE的试验数量有限，表明它们具有相似的诊断和治疗产量。然而DBE似乎是在执行完整肠镜[更为有效的 ]。

术中肠镜检查（IOE）是另一种选择，但在开发气囊小肠镜检查技术后，IOE不是最初的选择，因为它是无可比拟的侵入性。