经鼻EGD（TN-EGD）在弯曲方面具有一定的局限性，这使得难以接近某些胃区域。Rhee等人评估了双向TN-EGD活检胃标本的质量和数量是否受到这种限制的影响。  基于直径和深度（μm）以及组织层（浅表粘膜，深粘膜，肌层粘膜和粘膜下层）的存在来评估样本量。根据解剖学方向（良好，中等或差），挤压伪影的存在（无至最小，轻度或中度）和总体诊断充分性（充分，次优或不足）评估标本质量。

在289例TN-EGD胃活组织检查标本中，33例（11.4％）定向不良，26例（9.0％）显示存在挤压，37例（12.8％）显示整体诊断不足。 在211（73.0％），存在深粘膜，但只有75个标本（26.0％）有肌层粘膜。贲门的后部在样本数量和质量方面具有最大的局限性，深度最浅，最差的方向和最差的诊断充分性。研究人员建议在使用双向TN-EGD时特别注意位于贲门后部的胃部病变。

在一项由两部分组成的研究中，日本研究人员试图寻找一种良好的清洗液，以对抗TN-EGD用于清洗镜片的小口径水射流喷嘴的已知局限性。 Komazawa等人将乌龙茶，大麦茶和蒸馏水作为内窥镜镜片的洗涤液进行了比较。在研究的第一部分中，TN-EGD镜片被猪油污染，然后用三种洗涤溶液中的一种洗涤。当判断照片的图像质量时，用乌龙茶洗涤的镜片导致比用大麦茶或蒸馏水溶液洗涤的镜片显着更高的图像质量。

在该研究的第二部分中，计划接受TN-EGD的982名患者被随机分配到其中用三种洗涤溶液之一洗涤内窥镜镜片的组。研究人员发现，乌龙茶组的镜片清洁水平明显更高，内镜检查所需的总时间明显短于其他两组。 当比较用于镜片清洁的洗涤溶液的体积时，与蒸馏水组相比，在乌龙茶组中使用的量明显更少。根据他们的研究结果，Komazawa等人推荐使用乌龙茶而不是水来清洁TN小口径EGD镜片。