内窥镜检查单元是医院（或医生办公室）中的特定区域，其中执行所有内窥镜检查程序。对于这个单元是功能性和有效的，根据美国胃肠内镜协会（ASGE），某些必须满足的条件，包括以下内容：

经过适当培训的内窥镜医师和护理人员

功能和充分维护的设备

内窥镜清洁区域的可用性

接受过培训以进行心肺复苏的人员

质量改进计划到位

开放式内窥镜检查是一种系统，旨在抵消稳定患者的内窥镜检查费用，而无明显的合并症，这些合并症有明确的上胃肠道内窥镜检查指征。 转诊医师的职责是完全了解患者的病情和接受的内镜检查指征。如果患者正在接受抗凝治疗或需要进行抗生素预防，则必须通过转诊医师和内镜医师之间的适当沟通来解决这些问题。

根据ASGE的建议，上消化道内镜检查的培训应包括对适应症，局限性，禁忌症，替代方案，清醒镇静原则以及内镜检查结果的正确解释的理解。建议至少100个上消化道内镜手术程序，使受训人员能够胜任诊断性上胃肠道内窥镜检查。

治疗性上胃肠道内窥镜检查需要进一步的培训和经验才能获得胜任力。ASGE关于获得各种治疗性上消化道内镜手术能力所需程序数量的建议可通过社会网站获得。