幽门成形术最常作为胃引流术进行，其对于消化性溃疡病  （PUD）的迷走神经切断术是辅助的。（截短和选择性迷走神经切断术使幽门去幽门并需要幽门引流;高度选择性迷走神经切断术可以避免幽门，并且不需要引流程序。）随着H2受体解剖学家（H2RAs）和质子泵抑制剂（PPIs）的出现，选择适应症然而，PUD手术减少了。

另外，幽门成形术可以作为十二指肠溃疡出血的外科手术控制的第一步，并且很少用于穿孔的十二指肠溃疡。

幽门成形术也作为食管切除术和近端胃切除术中无意中迷走神经切断术的辅助手段。然而，幽门成形术作为接受食管切除术的患者无意中迷走神经切断术的辅助手段受到质疑，并且一些外科医生不执行它。 幽门内窥镜球囊扩张是外科幽门成形的替代方案。

罕见适应症包括婴儿幽门闭锁和老年患者胃轻瘫。Mancini等人的一项回顾性研究发现，幽门成形术对于治疗难治性胃轻瘫非常有效。

在选择性情况下，首先进行迷走神经切断术，然后进行幽门成形术。在紧急情况下（出血和穿孔），首先处理幽门，然后进行迷走神经切断术。