切除病变肠后恢复肠道连续性

患病肠的切除在以下设置中进行：

继发于肠系膜血管疾病，肠梗阻延长，肠套叠或肠扭转引起的血管损害的肠坏疽

恶性肿瘤

良性病症，如肠息肉，肠套叠或肠梗阻的蛔虫感染

感染，如 肺结核并发狭窄或穿孔

创伤性穿孔

大穿孔（创伤）不适合初次闭合

放射性肠炎并发出血，狭窄或穿孔

炎症性肠病（IBD），  溃疡性结肠炎  （UC）或 克罗恩病  （CD），当疾病难以进行药物治疗或伴有出血，穿孔，中毒性巨结肠或发育不良/癌等并发症时

慢性便秘，特发性慢传输性便秘或先天性巨结肠症，当疾病难以进行药物治疗时可进行次全结肠切除术

绕过无法切除的病变肠

不可切除的患病肠道的旁路在以下设置中进行：

局部晚期肿瘤引起管腔阻塞

转移性疾病引起肠梗阻

一般情况或状况不佳，可防止大切除

小儿病情

可能需要肠吻合的儿科病症包括：

先天性异常，如Meckel憩室，肠闭锁，肠旋转不良导致坏疽，胎粪性肠梗阻，重复囊肿和先天性巨结肠疾病

炎症性疾病，如坏死性肠炎，小肠结肠炎，肺结核和肠穿孔

其他情况，如肠套叠，血管发育不良，息肉病和蛔虫病

作为其他外科手术的一部分，如Kasai门静脉造口术，胆总管囊肿手术，尿流改道和胰腺肿瘤切除术