传统上，Barrett食管和高度不典型增生的患者接受了直接食管切除术，因为估计有40％的此类患者患有隐匿性癌症。2008年系统评价分析了441例Barrett食管和高度不典型增生患者的食管癌风险，这些患者接受了预防性食管切除术治疗高度不典型增生。虽然食管切除标本中隐匿性腺癌的合并平均率为39.9％，但已证实的浸润性癌症的发生率（仅由粘膜下侵犯或超出范围的存在所定义）仅为12.7％。其余的腺癌是粘膜内癌，其淋巴结转移的风险较低（约0-3％），可能适合局部治疗，如内镜下黏膜切除术。鉴于接受食管切除术的患者的死亡风险约为3-4％，即使在有经验的中心，使用内窥镜方法治疗高度不典型增生和粘膜内癌的风险：效益比也相对较低。因此，对隐匿性浸润性癌症的风险和内窥镜技术的进步的进一步理解，提供了使用内镜治疗来治疗Barrett食管患者的高度异型增生和粘膜内癌的基本原理。Barrett食管无发育不良或低度不典型增生的患者患癌症的风险较低，加上与内镜治疗相关的可能并发症的风险，表明消融治疗不能为这组患者提供相同水平的益处正如他们为高级别发育不良患者所做的那样。