腹腔镜检查的缺点，虽然腹腔镜手术在患者结果方面显然是有利的，但与传统的开放手术相比，从外科医生的角度来看，手术更加困难：

外科医生在手术部位的运动范围有限，导致灵活性的丧失。

深度感觉差。

外科医生必须使用工具与组织相互作用，而不是用手直接操作它。这导致不能准确地判断施加到组织的力的大小以及通过施加超过必要的力而损坏组织的风险。这种限制还降低了触感，使得外科医生更难以感觉到组织（有时是一种重要的诊断工具，例如当触诊肿瘤时）并且使诸如缝合缝合线之类的精细操作更加困难。

由于枢轴点，工具端点在与外科医生的手相反的方向上移动，使得腹腔镜手术成为难以学习的非直观的运动技能。这被称为支点效应。

当该区域可以打开时，一些外科手术（例如腕管）通常对患者更好，允许外科医生看到围绕生理学的“全貌”，以更好地解决手头的问题。在这方面，锁孔手术可能是一个缺点。