胃活组织检查的风险，大多数人经历很少或没有副作用。如果一个人在手术后出现任何异常症状，应立即告诉医生。

一个人从采集样本的地方出血量很少是正常的。此外，内窥镜可能会损坏小肠，胃或食道，尽管这种情况并不常见。

一个人可能会在手术过程中使用镇静剂或止痛药产生副作用。

对止痛药的不良反应可能导致以下症状：

低血压

心跳减慢

呼吸困难

喉部痉挛

出汗过多