医疗保险或医疗补助计划都没有报销CT结肠成像，其作为结肠息肉筛查工具的用途得到了更多数据的支持。然而，对于诊断性CT结肠成像的报销 - 例如，在经历了不完整的内窥镜结肠镜检查的患者中。

此外，MR结肠成像和CT结肠成像都可能有助于检测结肠外发现，这可能需要进一步调查，涉及进一步的成本并引起患者的焦虑。迄今为止，尚未对进一步评估MR结肠成像中发现的偶然发现的患者所进行的费用进行研究。然而，已经进行了筛查CT结肠成像的研究，重点是未预期的结肠外发现的临床和经济影响。Pickhardt等人最近审查了在2195名患者中进行的非对比筛查CT结肠检查。在他们的研究中，检测到204个未发现的具有中等潜在重要性的结肠外结果，133名患者（6.1％）对这些结果进行了进一步的检查，只有55名患者（2.5％）被诊断出患有至少中等重要性的意外情况（例如，肾细胞癌，胆管癌）。非手术程序的平均费用为31.02美元，外科手术的平均费用为67.54美元。作者总结了他们的发现，他说“明智地处理潜在的结肠外发现是有必要平衡额外检查的成本与早期发现重要疾病的可能性，因为许多发现将证明没有临床后果”。