难以拔管是一个常见的晚期问题。儿童的拔管问题可能是由于各种因素造成的。在考虑进行拔管时，下呼吸道必须没有感染和过多的分泌物。

如果拔管失败，必须进行显微喉镜检查和支气管镜检查，以显示气管中的任何造口颗粒或任何大的锁骨上气管标签阻塞管腔并评估声带的活动性。如果出现任何这些问题，必须在儿童拔管前解决。对管的心理依赖性并不像人们常说的那样普遍。

气管肉芽肿经常发生在非常年轻的患者身上，其中安全边缘反映了呼吸道的口径。最常见的原因是由于气管造口管远端尖端的创伤或过度抽吸引起的肉芽形成。这种并发症可能是由于物理特征（例如，管中增塑剂的运动和影响）和来自皮肤和气道的有助于形成颗粒的感染因素的组合。

随着幼儿发展手动灵活性以移除气管造口管，意外拔管变得更具风险。管移位和阻塞仍然是最重要的晚期并发症，并且死亡率为1-2％。

声门下狭窄通常是由于插管太高而太靠近环状软骨引起的。上颌骨塌陷和气管狭窄也是重要的并发症。在输卵管造口术时，子宫内膜塌陷的发生率随着孩子的年龄而反向增加。已经描述了用于声门上狭窄/塌陷的会厌重新定位技术。

持续性气管瘘的发生率为19-42％。

最后，气管切开术可以影响患有神经系统疾病的患者和不患有神经系统疾病的患者的言语和语言发展。影响神经健康组内言语和语言发展的关键因素包括气管切开术时的年龄和拔管前气管切开术的持续时间。尽早进行拔管可以提高正常言语和语言发展的机会。