食道镜检查通常在门诊环境中进行，但胃肠道疾病的住院和急诊科管理通常需要紧急住院上内窥镜检查，包括但不限于食道镜检查。此外，某些条件需要常规食管内窥镜监测和治疗。在这种情况下，手术可能仅限于食道探查。食道镜的适应症如下：

食物推注或异物撞击

评估和管理  胃食管反流病  （GERD）， 包括非心脏性胸痛。

筛选和监测  Barrett食管 （参见下面的视频）

食管静脉曲张的 治疗和监测 

评估和管理  吞咽困难， 包括食管狭窄的扩张

糜烂的评估和管理

评价和食道癌的管理，包括食管支架的放置

异常成像研究后食管的评估