腹腔镜抗反流手术的禁忌症包括：

外科医生缺乏经验

无法忍受 全身麻醉

无法忍受剖腹手术

晚期心肺疾病

不可纠正的凝血功能障碍

门脉高压症

相对禁忌症包括先前的上腹部手术和严重缩短的食道。由于高失败率，病态肥胖患者（体重指数[BMI]> 35 kg / m 2）应避免应用胃底折叠术（开腹或腹腔镜）。这些患者应考虑胃旁路术，而不是胃底折叠术。患有贲门失弛缓症等食管运动障碍的患者也应避免使用Nissen胃底折叠术。